272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0768 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
257 aa  275  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.42 
 
 
281 aa  261  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.88 
 
 
248 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  49.59 
 
 
255 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
249 aa  222  6e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.37 
 
 
181 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  54.03 
 
 
127 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 
275 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
299 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
295 aa  99  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 
387 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3346  4-carboxymuconolactone decarboxylase  66.67 
 
 
69 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.54 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.66 
 
 
136 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
150 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
129 aa  85.5  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
152 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.53 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.7 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.59 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  38.53 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.53 
 
 
128 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.53 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.53 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  38.53 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.75 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  33.05 
 
 
130 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.9 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  27.62 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  41.25 
 
 
122 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  26.29 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  36.44 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  40 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
144 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.09 
 
 
134 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
123 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.54 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.84 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.62 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  33.9 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
118 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  33.62 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  28.82 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 
128 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  21.58 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.26 
 
 
127 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.35 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
123 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.43 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
380 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.42 
 
 
398 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  24.23 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
127 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
127 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  22.75 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 
127 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  31.09 
 
 
129 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.09 
 
 
122 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  28.45 
 
 
128 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
128 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.08 
 
 
221 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
132 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  27.23 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
124 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  32.67 
 
 
373 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
125 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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