99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1079 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  59.43 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  55 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  54.1 
 
 		 387 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.38 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  50.48 
 
 		 403 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  44.81 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.29 
 
 		 428 aa  204  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  46.86 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  43.4 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.01 
 
 		 221 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  48.3 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  33.17 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.51 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  27.57 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.94 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.05 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  26.15 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 		 275 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  25.12 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  25.46 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  25.46 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  47.22 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.26 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.36 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.8 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  32.29 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  28.04 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  24.64 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 133 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  23.26 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 		 109 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  45.59 
 
 		 110 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 		 123 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 		 118 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  45.28 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  21.8 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.62 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 		 136 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.8 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 130 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 		 130 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 125 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  24.86 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 105 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  28.24 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.14 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  26.98 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 		 102 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.85 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  33.82 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.1 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.1 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  28.57 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.1 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 		 140 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 107 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>