More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001374 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
125 aa  259  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  82.11 
 
 
125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  82.79 
 
 
134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  69.11 
 
 
128 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  68.55 
 
 
128 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  67.48 
 
 
129 aa  180  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  68.29 
 
 
128 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  66.13 
 
 
132 aa  176  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  65.04 
 
 
133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.25 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  69 
 
 
109 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.28 
 
 
132 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 
138 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  69.07 
 
 
110 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  53.66 
 
 
130 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.71 
 
 
123 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.08 
 
 
138 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  60.83 
 
 
132 aa  146  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.22 
 
 
132 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  55.17 
 
 
148 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.56 
 
 
299 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.92 
 
 
118 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
150 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
131 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
152 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  58.54 
 
 
145 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
260 aa  140  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
144 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  58.12 
 
 
261 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  55.28 
 
 
144 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
144 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
144 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  55.28 
 
 
144 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  51.24 
 
 
275 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
295 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.93 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.78 
 
 
127 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 
122 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  38.52 
 
 
373 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.17 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.17 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.6 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.54 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  38.05 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.9 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1069  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00016362  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
283 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  40.86 
 
 
259 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.89 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
363 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
283 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.5 
 
 
402 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 
380 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  43.02 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  47.31 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  38.05 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.19 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.82 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  32.77 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2237  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.64 
 
 
256 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>