24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2416 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  44.61 
 
 		 308 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  40.4 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  40.4 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  40.4 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  41.12 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.64 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 		 403 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  25.7 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  28.22 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.43 
 
 		 398 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  32.53 
 
 		 396 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  23.61 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  23.43 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  22.61 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  22.61 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.43 
 
 		 244 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  20.9 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>