240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4219 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  75.21 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  53.28 
 
 		 266 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  50.63 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  49.79 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  49.79 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  49.79 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  56.45 
 
 		 198 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  29.25 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  30.05 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  28.05 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  28.37 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  27.32 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  26.41 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  26.41 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 		 107 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  23.92 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.62 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.93 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  38.14 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.49 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  34.95 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 128 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.22 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 128 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.73 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  42.03 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.63 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  37.5 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  32.18 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  28.85 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  35.21 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.93 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  33.01 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  28.85 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 129 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  37.68 
 
 		 109 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 123 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  37.62 
 
 		 127 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 136 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  43.94 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 129 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 110 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 127 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 123 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 129 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 123 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 		 107 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 129 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>