221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5154 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  77.18 
 
 		 149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  78.08 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  78.08 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  78.08 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.43 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.87 
 
 		 393 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  33.7 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.55 
 
 		 402 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 398 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.47 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 393 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 393 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 393 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 393 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.02 
 
 		 393 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  34.83 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.08 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  36.62 
 
 		 276 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  26.17 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  35.62 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 275 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  34.44 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  31 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  34.94 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  27.64 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  31.08 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.81 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0504  putative carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 		 254 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0936685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.16 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>