73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0504 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0504  putative carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0936685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  26.12 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  21.97 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  32.11 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.59 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  21.86 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.94 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.75 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 125 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  32.71 
 
 		 125 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  32.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 		 128 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.96 
 
 		 152 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 		 148 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 129 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 131 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 129 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.41 
 
 		 126 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  22.6 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 143 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  37.04 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  18.57 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  33.75 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  32.67 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.35 
 
 		 136 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 108 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 128 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.29 
 
 		 127 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.04 
 
 		 392 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.19 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 128 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 128 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 128 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 128 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.19 
 
 		 118 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  28.75 
 
 		 130 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  29.41 
 
 		 108 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>