201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10786 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  60.56 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  60.56 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  60.56 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  61.43 
 
 		 152 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  60.14 
 
 		 149 aa  186  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.97 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  49.07 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  32.05 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  37 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.67 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.31 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  35.23 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.75 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  37.84 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 		 268 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 261 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.58 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 		 276 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  37.66 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  35.64 
 
 		 262 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.33 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  36.47 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  31.43 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  34.74 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.12 
 
 		 391 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.57 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  37.66 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 265 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  31.17 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 283 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 283 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.03 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.92 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 		 264 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.87 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>