95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3284 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  56.45 
 
 		 308 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  56.45 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  46.7 
 
 		 269 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  46.7 
 
 		 269 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  46.7 
 
 		 269 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  47.21 
 
 		 266 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  45.21 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  28.45 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  26.58 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 128 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 128 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  35 
 
 		 373 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 134 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.27 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  25.75 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 127 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  25.32 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 128 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  26.27 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.15 
 
 		 398 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 126 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 131 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 		 129 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  25.81 
 
 		 396 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.33 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  24.21 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.94 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  24.72 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  24.21 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  27.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  31.68 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  31.63 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  26.17 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  24.21 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 132 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.73 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.88 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 134 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 136 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 		 396 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  28.89 
 
 		 380 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 129 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.88 
 
 		 118 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 238 aa  42  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  36.51 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.88 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  32.91 
 
 		 106 aa  41.6  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 125 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  25.74 
 
 		 300 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.87 
 
 		 393 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>