More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1577 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  70.43 
 
 		 393 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  72.65 
 
 		 391 aa  173  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.17 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.99 
 
 		 402 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.08 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 128 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.1 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.9 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  56.91 
 
 		 373 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.68 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.16 
 
 		 393 aa  153  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 393 aa  153  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 393 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 393 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 393 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 393 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.98 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.95 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  60.71 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.39 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  61.95 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.98 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.98 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.93 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.5 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.93 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.93 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  61.61 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.04 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.18 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  58.04 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.04 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.13 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  71.43 
 
 		 397 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  55.65 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  60.36 
 
 		 392 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  55 
 
 		 396 aa  141  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.82 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.81 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.78 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.93 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.62 
 
 		 400 aa  136  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  53.12 
 
 		 425 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  56.2 
 
 		 386 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  52.59 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  53.85 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.76 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  50.83 
 
 		 128 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.24 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.78 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  52.89 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.03 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  53.23 
 
 		 390 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  53.72 
 
 		 397 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.21 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  47.06 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  44.63 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.3 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  52.68 
 
 		 393 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  55.36 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  51.79 
 
 		 393 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.79 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3323  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 		 129 aa  121  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  53.04 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 389 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  46.02 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>