295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4713 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
300 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  33.91 
 
 
259 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  29.7 
 
 
256 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.9 
 
 
398 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
299 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  31.93 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  29.74 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  29.74 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  31.22 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  54.79 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  30.87 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  30.45 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  27.23 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.13 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.89 
 
 
128 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  52.05 
 
 
125 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 
128 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 
132 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  48.75 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 
128 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  51.9 
 
 
136 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 
129 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 
128 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  44.3 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 
128 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 
128 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.81 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 
125 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  25.66 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 
132 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  45.24 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  45.57 
 
 
148 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.35 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  45.95 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.59 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.05 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  52.05 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  52.05 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  52.46 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.47 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.68 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  45.57 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  44.74 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.42 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.22 
 
 
138 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.73 
 
 
134 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.81 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.1 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  47.44 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.68 
 
 
122 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  44.59 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  48.05 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  44.87 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  48.05 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  46.75 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  41.1 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.43 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.89 
 
 
128 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  45.33 
 
 
134 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  41.89 
 
 
130 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  48.05 
 
 
155 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  49.32 
 
 
128 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  44.87 
 
 
129 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.1 
 
 
140 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  48.05 
 
 
155 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
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