294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3404 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  80.47 
 
 
129 aa  215  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  79.69 
 
 
129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  67.94 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  68.66 
 
 
134 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2482  carboxymuconolactone decarboxylase  52 
 
 
126 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
132 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.1 
 
 
127 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.58 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  48.74 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
123 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1592  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0226271  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
129 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  46.56 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  48.74 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  52.59 
 
 
133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  44.27 
 
 
129 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
134 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
134 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
129 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.7 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  46.9 
 
 
129 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.31 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  50.43 
 
 
129 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.55 
 
 
127 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  46.77 
 
 
396 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
126 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
128 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  52.68 
 
 
128 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  52.1 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.69 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
127 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.15 
 
 
131 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  45.9 
 
 
392 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  47.75 
 
 
131 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.85 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  41.88 
 
 
157 aa  111  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
129 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
129 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  43.22 
 
 
373 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
129 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
126 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  42.19 
 
 
130 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.92 
 
 
128 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.61 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.98 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
132 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.98 
 
 
129 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  47.2 
 
 
391 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.62 
 
 
128 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  41.22 
 
 
133 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
132 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
130 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  41.22 
 
 
133 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
148 aa  103  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  50.43 
 
 
393 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
130 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
149 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
152 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  50.44 
 
 
393 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.52 
 
 
132 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  42.28 
 
 
393 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
402 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
122 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  43.75 
 
 
131 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.59 
 
 
131 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>