279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3252 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
133 aa  276  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  77.78 
 
 
131 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  75.4 
 
 
131 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  73.55 
 
 
132 aa  195  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  72.73 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  72.73 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  57.26 
 
 
126 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  57.26 
 
 
126 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  51.56 
 
 
129 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  51.2 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  50.39 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  50.78 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.26 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
129 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.85 
 
 
127 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.72 
 
 
129 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  49.6 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  50.83 
 
 
132 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.63 
 
 
123 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  48.39 
 
 
137 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 
136 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.42 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.94 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  50.81 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.7 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  43.41 
 
 
157 aa  128  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
128 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.77 
 
 
130 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  46.77 
 
 
128 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
134 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
134 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  45.97 
 
 
133 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
134 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  48 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  46.83 
 
 
131 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.03 
 
 
132 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  48 
 
 
128 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  45.74 
 
 
128 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
130 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.8 
 
 
128 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
128 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 
128 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
130 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
133 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
130 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  44.44 
 
 
396 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  46.67 
 
 
129 aa  119  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  42.86 
 
 
392 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1592  carboxymuconolactone decarboxylase  48.25 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0226271  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  46.67 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2482  carboxymuconolactone decarboxylase  48.28 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.31 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.53 
 
 
129 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.88 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  46.34 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  44.09 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.08 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.24 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  48.62 
 
 
393 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.74 
 
 
130 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.4 
 
 
128 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  43.2 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  48.31 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.13 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  47.66 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.07 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
133 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.4 
 
 
127 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  45.22 
 
 
124 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.13 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.32 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 
153 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.1 
 
 
127 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  45.54 
 
 
373 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
185 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
132 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 
149 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
132 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 
132 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.06 
 
 
132 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  43.09 
 
 
132 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
137 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>