258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2482 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2482  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
126 aa  259  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1592  carboxymuconolactone decarboxylase  68.85 
 
 
125 aa  191  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0226271  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  53.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  52.38 
 
 
129 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  48.36 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  53.28 
 
 
126 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  50.79 
 
 
129 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.72 
 
 
129 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48 
 
 
125 aa  137  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  51.64 
 
 
126 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  54.05 
 
 
131 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  45.9 
 
 
126 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  46.72 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  46.72 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  46.28 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.7 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  52.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.14 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  45.9 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.54 
 
 
123 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  46.72 
 
 
126 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  48.7 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.7 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.16 
 
 
127 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
137 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
132 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
132 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
154 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
128 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
132 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
128 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
131 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
134 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
131 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
134 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
155 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
134 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
128 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
155 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
132 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
132 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
132 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
132 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  39.32 
 
 
152 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
185 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
132 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
132 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
132 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.34 
 
 
402 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
396 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
129 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.19 
 
 
392 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  100  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  40.52 
 
 
391 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.59 
 
 
393 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.84 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  37.9 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  39.83 
 
 
393 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  37.19 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  39.81 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  38.39 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  39.13 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
393 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>