More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0681 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  98.44 
 
 
128 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  98.44 
 
 
128 aa  263  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  89.06 
 
 
128 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  85.94 
 
 
134 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  85.94 
 
 
134 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  85.16 
 
 
134 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.81 
 
 
127 aa  206  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  63.71 
 
 
128 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  64.52 
 
 
128 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64 
 
 
127 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  65.55 
 
 
124 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  62.6 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.64 
 
 
126 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
127 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 
129 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
125 aa  157  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  50.78 
 
 
129 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  55.65 
 
 
125 aa  150  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 
129 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  49.22 
 
 
129 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  49.22 
 
 
129 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 
134 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
128 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
129 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.64 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  143  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  56.3 
 
 
149 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  53.78 
 
 
136 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 
129 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.9 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.26 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  53.72 
 
 
153 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  56.78 
 
 
133 aa  138  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  48.76 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 
126 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  52.46 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  42.62 
 
 
126 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
128 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.06 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
128 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  46.4 
 
 
131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  47.54 
 
 
373 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.67 
 
 
134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
154 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
132 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.03 
 
 
132 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
185 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
131 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
132 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  50.43 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  51.75 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.67 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  47.97 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
132 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
133 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
130 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
132 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
130 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
130 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  48.36 
 
 
132 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.7 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.76 
 
 
402 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  45.9 
 
 
132 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
393 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
134 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  47.54 
 
 
129 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  45.97 
 
 
392 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  41.73 
 
 
131 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>