More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1216 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
132 aa  276  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  98.47 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  97.71 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  71.76 
 
 
131 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  68.99 
 
 
131 aa  203  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  74.31 
 
 
133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  52.99 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
129 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  46.83 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
132 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
127 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  46.83 
 
 
129 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.7 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
123 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  49.19 
 
 
126 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.22 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  47.46 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  44.92 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.76 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1592  carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 
125 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0226271  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.23 
 
 
129 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.54 
 
 
137 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  42.98 
 
 
157 aa  120  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 
129 aa  120  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 
131 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.31 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  48.18 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  45.74 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
125 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2482  carboxymuconolactone decarboxylase  48.7 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  47.01 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.65 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.46 
 
 
132 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  47.01 
 
 
393 aa  116  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  43.2 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  46.85 
 
 
134 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.41 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.4 
 
 
134 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
128 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.4 
 
 
134 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.4 
 
 
134 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
393 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.94 
 
 
129 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 
128 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.76 
 
 
128 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  42.28 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.77 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
130 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.52 
 
 
132 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  46.85 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
130 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
130 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
130 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  48.65 
 
 
129 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  42.98 
 
 
396 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40.34 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 
393 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.8 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  41.8 
 
 
392 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 
134 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.52 
 
 
154 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  40.16 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
127 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.34 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
127 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.08 
 
 
132 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 
129 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  44.92 
 
 
128 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.58 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>