203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1603 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  77.18 
 
 		 152 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  75.51 
 
 		 146 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  75.51 
 
 		 146 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  75.51 
 
 		 146 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.14 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  44.04 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.96 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  28.45 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  33.7 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  40.58 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 		 398 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.25 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  31.34 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  36.49 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 239 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  27.36 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 		 402 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.11 
 
 		 373 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  37.68 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 260 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.47 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.85 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0504  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0936685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.66 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  26.73 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  36.62 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 393 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  31.68 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  39.06 
 
 		 397 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  36.49 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  37.25 
 
 		 298 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 393 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 393 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 393 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 393 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>