104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3850 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  49.14 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  49.14 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  49.14 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.97 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  45.3 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 		 267 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  40.79 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 398 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  35.11 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  36.47 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  39.19 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  32.97 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  37.96 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.03 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 265 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  38.36 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.65 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  39.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  38.96 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.39 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  36.71 
 
 		 298 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  39.71 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  37.66 
 
 		 391 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  43.55 
 
 		 397 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  38.24 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.25 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.21 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.68 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.36 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  25.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  29.93 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  25.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  41.1 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.62 
 
 		 397 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  35.82 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.23 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.06 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.62 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.62 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  32.05 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 		 402 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.68 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 396 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 300 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>