161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2947 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.3 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  53.42 
 
 		 387 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.38 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  55.07 
 
 		 403 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  45.83 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  49.52 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.69 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  44.39 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.64 
 
 		 428 aa  195  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.76 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  43.08 
 
 		 168 aa  112  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  34.07 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  33.16 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.35 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.98 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  25.36 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  29.71 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  25.36 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  30.6 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.58 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.66 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.24 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.48 
 
 		 128 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  44.93 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.84 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.47 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.1 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.06 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  43.06 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  43.06 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  43.06 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.71 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.19 
 
 		 118 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  26.07 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  50.91 
 
 		 130 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0504  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0936685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.84 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.36 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.7 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 		 129 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 107 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  26.07 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  39.34 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  27.2 
 
 		 127 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 		 107 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  30.72 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 105 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.82 
 
 		 126 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 		 106 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  22.34 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  24.21 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  32.35 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  42.37 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  36.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.9 
 
 		 380 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 132 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 122 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  44 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  30.88 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.94 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>