175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2032 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
250 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.26 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.17 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  41.38 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  40.56 
 
 
181 aa  135  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  50.81 
 
 
127 aa  131  9e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.39 
 
 
299 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.99 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  38.78 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  26.2 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.71 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.96 
 
 
132 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.11 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  24.28 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.23 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
130 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  29.95 
 
 
387 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
148 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
123 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
134 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  29.26 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
118 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
133 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  42.17 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 
125 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.47 
 
 
110 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  26.22 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.05 
 
 
152 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
144 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 
125 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
145 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
152 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  34.09 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
132 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
428 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  27.57 
 
 
403 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  27.05 
 
 
129 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.57 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  39.44 
 
 
123 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
125 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 
396 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  23.61 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
122 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3346  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
69 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 
127 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  28.97 
 
 
127 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.61 
 
 
398 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  23.18 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  23.33 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  23.33 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
130 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
150 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
126 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 
132 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.78 
 
 
127 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 
136 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
132 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
129 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.27 
 
 
123 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
132 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
132 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
132 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  23.11 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
132 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
132 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  28.04 
 
 
124 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
132 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
132 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>