81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5749 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  72.02 
 
 		 263 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  69.86 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.4 
 
 		 252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  49.52 
 
 		 238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  50.48 
 
 		 387 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.76 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  46.08 
 
 		 403 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  45.79 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.01 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.88 
 
 		 428 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  44.8 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.84 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  28.57 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.95 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.57 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.7 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  43.28 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.73 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.49 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.49 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  27.96 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.84 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 123 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  39.73 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  38.81 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 396 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 118 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.57 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  32.93 
 
 		 127 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 		 380 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.68 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 125 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  27.08 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 130 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 131 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 130 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  38.33 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  30.99 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 		 373 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 238 aa  42  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 144 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.38 
 
 		 99 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.18 
 
 		 127 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  30 
 
 		 104 aa  41.6  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>