162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0170 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
257 aa  533  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
250 aa  275  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.95 
 
 
248 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.57 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  51.63 
 
 
181 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.17 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  40.49 
 
 
255 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  42.15 
 
 
127 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  28.26 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.75 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  27.75 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.04 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  31.71 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  44.29 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  41.03 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  24.44 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
110 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.19 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
132 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 
123 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  36.7 
 
 
133 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.62 
 
 
130 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3346  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 
69 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
129 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.71 
 
 
128 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
130 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.93 
 
 
127 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 
138 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
299 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
118 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 
128 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.09 
 
 
125 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 
128 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
134 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 
128 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 
128 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 
403 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.44 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
148 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
125 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
132 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
138 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.61 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.97 
 
 
398 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  43.04 
 
 
144 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 
428 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  25.11 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 
132 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  41.77 
 
 
144 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.84 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
127 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  40.26 
 
 
145 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
131 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  26.02 
 
 
131 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
123 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
125 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
133 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
134 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
134 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
134 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  29.36 
 
 
390 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  22.67 
 
 
396 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  23.61 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  24.89 
 
 
363 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 
402 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.91 
 
 
132 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
129 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.1 
 
 
133 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 
99 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>