228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3793 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.42 
 
 
252 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  51.91 
 
 
387 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  53.3 
 
 
238 aa  257  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 
403 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.69 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.75 
 
 
244 aa  215  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  47.39 
 
 
263 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  47.34 
 
 
262 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  41.81 
 
 
241 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.33 
 
 
221 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.3 
 
 
428 aa  182  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  43.62 
 
 
168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  31.34 
 
 
261 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
398 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  26.94 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  23.94 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.31 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.2 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  27.13 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  27.18 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  47.76 
 
 
110 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  28.65 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  24.4 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  49.25 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.03 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  27.62 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 
148 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
123 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 
129 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  24.65 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
152 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
131 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.28 
 
 
118 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  26.6 
 
 
265 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  23.92 
 
 
262 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 
257 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
122 aa  62  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 
132 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.71 
 
 
130 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.39 
 
 
136 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
133 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
152 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 
138 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  22.97 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
150 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  30.85 
 
 
128 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  30.85 
 
 
128 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  24.61 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  26.32 
 
 
127 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 
99 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  28.77 
 
 
123 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
154 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 
125 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 
127 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
124 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 
129 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  20.95 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 
127 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  22.66 
 
 
308 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
108 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.59 
 
 
127 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.76 
 
 
132 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.1 
 
 
105 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 
126 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 
125 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.76 
 
 
133 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  26.2 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.76 
 
 
132 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 
127 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>