221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  100 
 
 
123 aa  255  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.34 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
257 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  36.45 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.56 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
248 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  35.37 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
398 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  34.23 
 
 
275 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.38 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.16 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  35.11 
 
 
181 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 
281 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  34.02 
 
 
259 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  31.07 
 
 
380 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  33.7 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  30.48 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
260 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  34.83 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  32.29 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  33.03 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 
265 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  33.03 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  34.21 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  29.46 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
264 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
255 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  33.03 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  27.27 
 
 
256 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 
244 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 
238 aa  52.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 
140 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>