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for query gene Reut_B5696 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
130 aa  259  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
133 aa  168  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.6 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  62.6 
 
 
129 aa  157  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.96 
 
 
152 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  55.12 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.56 
 
 
128 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  57.72 
 
 
128 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.72 
 
 
128 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  57.72 
 
 
128 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  57.72 
 
 
128 aa  153  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.66 
 
 
125 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.93 
 
 
138 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  50.78 
 
 
134 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
125 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 
109 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  60 
 
 
299 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.97 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.97 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.97 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.97 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.47 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.17 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.17 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.17 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.66 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  53.23 
 
 
148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
138 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  60 
 
 
132 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.37 
 
 
123 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  63.92 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 
261 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  58.27 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.89 
 
 
118 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.51 
 
 
260 aa  127  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  57.48 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  48.36 
 
 
295 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.15 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  57.5 
 
 
144 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  57.5 
 
 
144 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 
144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 
144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 
145 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  49.6 
 
 
150 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  46.61 
 
 
275 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 
136 aa  110  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.62 
 
 
127 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  44.35 
 
 
380 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  44.96 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.05 
 
 
250 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  36.57 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  35.82 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  35.82 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.89 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  35.78 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.89 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.48 
 
 
256 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  35.09 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  35.09 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  38.38 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  38.38 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  34.55 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  36.75 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.77 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.4 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  42.05 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  43.82 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  38.95 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.77 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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