223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6128 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
125 aa  256  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.68 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  37.11 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  33.63 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.04 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.05 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
261 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.91 
 
 
380 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  30.97 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  35.63 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 
275 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.35 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.14 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
250 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.63 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
248 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.27 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.67 
 
 
299 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 
124 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 
124 aa  57  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.05 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  31.96 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2237  carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 
398 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  31.68 
 
 
300 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 
402 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  31.18 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  30.12 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2236  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.34 
 
 
391 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 
396 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  30.11 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  36.46 
 
 
397 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>