276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6820 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6820  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0311  carboxymuconolactone decarboxylase  46.85 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1219  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 
149 aa  92  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  40.98 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.21 
 
 
373 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  31.5 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  35.54 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  45 
 
 
393 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  31.5 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  31.5 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
402 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  38.21 
 
 
391 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  32.03 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  45.65 
 
 
393 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.68 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  37.74 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  37.08 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  35.2 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  30.47 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  33.86 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.06 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.06 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  34.4 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  35.96 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.51 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.4 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.27 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  31.36 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  34.02 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.06 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.06 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.06 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.46 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  32.43 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.8 
 
 
392 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  36.28 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.32 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  31.09 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.38 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
396 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  41.41 
 
 
397 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.45 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  32.11 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  32.03 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  30.48 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  36.94 
 
 
389 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>