221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0311 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0311  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
143 aa  291  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1219  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6820  carboxymuconolactone decarboxylase  46.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  30.71 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  34.4 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  33.87 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.51 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  29.51 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  33.93 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.93 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  30.48 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  33.86 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  30.3 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  31 
 
 
264 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.9 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.74 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  30.19 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  29.55 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  33.71 
 
 
262 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  30.65 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.42 
 
 
239 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  28.28 
 
 
298 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.77 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.77 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.28 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 
392 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  28.79 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  27.18 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>