More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1303 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
442 aa  855    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1046  putative diguanylate cyclase  36.94 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.25674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
1676 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.89 
 
 
924 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
1714 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.52 
 
 
945 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 
1273 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1714  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 
920 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.183434  normal  0.382108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.76 
 
 
704 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  32.26 
 
 
1248 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35 
 
 
954 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  31.9 
 
 
1101 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
1191 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
929 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.94 
 
 
862 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
2693 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  26.04 
 
 
657 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.35 
 
 
1182 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1313  PAS sensor protein  34.55 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.83 
 
 
1047 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
1226 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.61 
 
 
953 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2666  putative sensor protein  34.88 
 
 
1129 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
1229 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
3706 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
712 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0529  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 
953 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.5 
 
 
707 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0591  putative sensor protein  33.33 
 
 
1121 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  25.5 
 
 
936 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.2 
 
 
754 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 
956 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  31.3 
 
 
685 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
1118 aa  67  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.09 
 
 
1561 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  30.33 
 
 
1289 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.14 
 
 
958 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
998 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  30.86 
 
 
1178 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  29.66 
 
 
1019 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0203  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 
718 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  30.53 
 
 
965 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.7 
 
 
1560 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
1109 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  52.86 
 
 
212 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1350 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0348  putative GAF sensor protein  58.62 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.69 
 
 
1212 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 
727 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1069 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 
222 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3508  diguanylate cyclase  26.23 
 
 
358 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00123099  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1116 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
801 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3536  putative sensory transduction histidine kinase  30.17 
 
 
161 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0560358  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.11 
 
 
821 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.45 
 
 
1278 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
745 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
231 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
219 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 
381 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6278  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.85 
 
 
1064 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.719663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1124 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
568 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 
302 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  52.11 
 
 
301 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1090 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 
228 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.43 
 
 
446 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1596 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 
253 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  57.89 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0614  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 
727 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8657800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
214 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 
230 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1224 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 
218 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0374  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.48 
 
 
840 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  53.45 
 
 
234 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1096 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
733 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4198  putative sensor protein  28.57 
 
 
1105 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 
211 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  57.41 
 
 
250 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
216 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
645 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
221 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
1808 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
1122 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  31.97 
 
 
734 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
1484 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
191 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
1178 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30 
 
 
1070 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3393  putative PAS/PAC sensor protein  24.53 
 
 
545 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1625 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.25 
 
 
872 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>