217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6095 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  42.65 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  46.38 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  43.69 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  47.37 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  35.05 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  40 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  38.27 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  37.84 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.87 
 
 		 444 aa  89  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.59 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25.59 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  26.07 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  25.71 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25.71 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.71 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.71 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25.71 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25.71 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  26.07 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  28.02 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  27.91 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.57 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  25.35 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.67 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  29.85 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  29.33 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  26.97 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  26.51 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  29.1 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  30.08 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.29 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  24.35 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  24.69 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  27.87 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  27.73 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  27.85 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.09 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  30 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.36 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  32.03 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  31.88 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  25.6 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 327 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 327 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  29.51 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  36.79 
 
 		 363 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  21.35 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  28.18 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  25.35 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  25.71 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  25.52 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  25.71 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.62 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>