More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5259 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  86.67 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  67.62 
 
 		 211 aa  304  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  65.24 
 
 		 210 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  64.29 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  63.81 
 
 		 210 aa  290  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  63.33 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  63.94 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  63.29 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  59.13 
 
 		 211 aa  247  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  58.65 
 
 		 211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  34.72 
 
 		 219 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.33 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  41.43 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  38.97 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  32.07 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.8 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.71 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  35.63 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  35.67 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  27.88 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  30.69 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.82 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  32.93 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.19 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 194 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  30.89 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  40.44 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.82 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 246 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  29.72 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.05 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  34.93 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>