More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3360 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  51.67 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  46.12 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  43.37 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  43.28 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  45.06 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  47.47 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  39.76 
 
 		 291 aa  142  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  46.94 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  47.52 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  45.96 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  44.05 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  43.23 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  39.27 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1519  PrrC  40.57 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  40.57 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  40.57 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  42.41 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  42.08 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
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NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  44.79 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
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NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  41.4 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  42.48 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
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NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  44.93 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  35.93 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
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NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  40.85 
 
 		 297 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
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NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 185 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  44.2 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.28 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.35 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  36.88 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  42.96 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.71 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  38.24 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 181 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  44.03 
 
 		 181 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  42.54 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  32.98 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  30.3 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
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NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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