291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1519 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



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Replicon accession
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Product
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1519  PrrC  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  86.58 
 
 		 231 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  58.33 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  55.5 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  51.53 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  49.27 
 
 		 210 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.57 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  38 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  36.76 
 
 		 287 aa  131  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  43.04 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  35.2 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  41.62 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.54 
 
 		 291 aa  124  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  38.99 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  38.61 
 
 		 171 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.65 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 		 193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.16 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  42.42 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 166 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  34.94 
 
 		 706 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32.14 
 
 		 197 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  31.64 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 203 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  30.16 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  38.4 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.23 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.78 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  26.54 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.81 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  28.31 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 202 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  34.92 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  35.81 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  25.31 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
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