264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3196 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 
206 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 
215 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.62 
 
 
203 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 
198 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.67 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
197 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.55 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  30.22 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  35.77 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  34.07 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  29.49 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.57 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  30.99 
 
 
291 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.17 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  30.99 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  30.16 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  30.86 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  28.8 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  32.48 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  27.37 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.55 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  27.08 
 
 
297 aa  74.7  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  32.1 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  32.1 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  28.02 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  26.74 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.47 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
204 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 
706 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  29.14 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  29.93 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  29.55 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  29.1 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  28.66 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  28.57 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
223 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  28.57 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  28.57 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  25.44 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
223 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  26.24 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  26.57 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
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