More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0885 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  85.43 
 
 		 199 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  81.91 
 
 		 199 aa  320  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  71.94 
 
 		 197 aa  305  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  71.88 
 
 		 197 aa  299  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  77.84 
 
 		 196 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  68.59 
 
 		 197 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  58.46 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  53.97 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  51.5 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  51.5 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  50.78 
 
 		 193 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  51.2 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  56.46 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  49.36 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  51.03 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  42.64 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  44.27 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  45.93 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  45.09 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  47.17 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  46.3 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  46.3 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  47.02 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  48.08 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40.51 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  39.69 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  39.69 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  41.8 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  45.12 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  43.29 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  47.02 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  39.01 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  39.71 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  45.75 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  44.87 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  44.87 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  41.1 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.78 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  48.92 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  43.95 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.86 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.86 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  45.93 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.22 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.22 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.22 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  43.88 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0373  lipoprotein  41.92 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
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NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  42.21 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  35.71 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  45.19 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  41.86 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.4 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  40.36 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 219 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
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BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  35.06 
 
 		 287 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  44.27 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  38.71 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
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