More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2820 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  51.67 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  46.6 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  45.96 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.82 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.38 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  47.55 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.58 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
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NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  35.15 
 
 		 291 aa  128  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  35.71 
 
 		 287 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  39.11 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  44.68 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  40.76 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.34 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  42.77 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.41 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  37.34 
 
 		 286 aa  121  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  38.5 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  43.06 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.33 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.53 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  39.77 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  38.25 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.99 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  38.02 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  40.35 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  40.37 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39.63 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  39.52 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  35.08 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  35.71 
 
 		 297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  32.66 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 		 275 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  36.02 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.82 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.6 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.6 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  34.16 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  29.87 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
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