More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3172 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  63.35 
 
 
210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  64.84 
 
 
207 aa  255  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  63.19 
 
 
203 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  63.19 
 
 
187 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  60.5 
 
 
209 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  57.79 
 
 
204 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  63.59 
 
 
209 aa  237  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  57.22 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  53.2 
 
 
206 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  58.43 
 
 
211 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  58.38 
 
 
221 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  57.06 
 
 
231 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  59.52 
 
 
197 aa  207  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  57.92 
 
 
181 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  55.96 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  55.96 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  55.93 
 
 
203 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  55.96 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  53.03 
 
 
196 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  55.96 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  55.96 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  55.37 
 
 
203 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  56.83 
 
 
181 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  56.83 
 
 
181 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  57.45 
 
 
205 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  58.01 
 
 
205 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  51.79 
 
 
201 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  51.26 
 
 
194 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  55.05 
 
 
205 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  55.05 
 
 
205 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  56.91 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  57.07 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  54.55 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  54.55 
 
 
200 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  53.19 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  51.53 
 
 
205 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  51.53 
 
 
205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  52.57 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  51.69 
 
 
192 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  50.56 
 
 
197 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  48.59 
 
 
205 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  47.31 
 
 
264 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  51.55 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  47.95 
 
 
201 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  43.37 
 
 
191 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  43.33 
 
 
188 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  47.75 
 
 
202 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  46.29 
 
 
201 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  48.31 
 
 
202 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  48.31 
 
 
223 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  48.31 
 
 
223 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 
197 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.37 
 
 
197 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  36.04 
 
 
197 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  35.53 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  44.08 
 
 
221 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.65 
 
 
204 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  45.75 
 
 
199 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  45.75 
 
 
199 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  54.33 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  45.75 
 
 
199 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 
220 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 
226 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 
196 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  41.84 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.75 
 
 
204 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 
197 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 
219 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 
197 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  43.14 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  41.29 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.84 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.86 
 
 
203 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 
206 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  44.85 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  39.51 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  40 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  41.83 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.06 
 
 
209 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  42.48 
 
 
196 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
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NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  39.1 
 
 
196 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  39.1 
 
 
196 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 
210 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 
210 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 
197 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 
219 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
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NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 
210 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 
210 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 
197 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 
204 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
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