More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0888 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 210 aa  433  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  77.67 
 
 		 209 aa  343  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  66 
 
 		 203 aa  292  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  69.95 
 
 		 187 aa  288  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  73.08 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  62.12 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  64.8 
 
 		 209 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  63.35 
 
 		 198 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  57.5 
 
 		 204 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  55.72 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  54.12 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  54.21 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  55.68 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  52.36 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  49.75 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  51.83 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  54.34 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  49.75 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  49.75 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  49.75 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  49.75 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  47.59 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  51.37 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  53.33 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  50.26 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  49.01 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  53.11 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  51.05 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  49.51 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  49.51 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  50.53 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  52.22 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  52.22 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  53.26 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  54.6 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  52.69 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  54.86 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  50.58 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  45.26 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  47.7 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  48 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  44.89 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  47.34 
 
 		 264 aa  171  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  43.85 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  46.07 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  46.07 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  46.07 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 201 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.21 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  38.07 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  37.56 
 
 		 202 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  40.85 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.1 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  43.67 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.22 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  41.71 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  46.21 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.67 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  46.04 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  42.67 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  41.29 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  40.22 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  47.69 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  46.21 
 
 		 197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  45.67 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  32.02 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  32.02 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  33.71 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  33.71 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  33.71 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.33 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  38.04 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.03 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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