More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4303 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  94.66 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  77.47 
 
 		 198 aa  293  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  69.61 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  44.56 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  46.76 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  48.18 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  48.91 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  48.91 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.38 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  38.07 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  42.18 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  41.29 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39.63 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  44.53 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  42.34 
 
 		 226 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.79 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  32.34 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  40.4 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  39.63 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  39.47 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  39.07 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  39.07 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  36.17 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.96 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.25 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  35.06 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  40.27 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  40.13 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.73 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  42.42 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  42.47 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.97 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  32.92 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  32.92 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.81 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  41.91 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  43.94 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.91 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  38.19 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  39.07 
 
 		 310 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  36.96 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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