264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2839 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  62.62 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  62.15 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  61.11 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  61.11 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  57.97 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  52.2 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.77 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39.08 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  39.77 
 
 		 291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  41.25 
 
 		 286 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.88 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.5 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  38.69 
 
 		 287 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.36 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.52 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  42.66 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  37.32 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.1 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  32.22 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.13 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  32.72 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  29.61 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.56 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  27.27 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.96 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.37 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  29.46 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  29.46 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  28.57 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.85 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 		 706 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.08 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  31.08 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  31.08 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  31.08 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  32.35 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  31.08 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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