More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4652 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  43.09 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  43.85 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.08 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  46.1 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39.3 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  39.51 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.98 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.94 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  43.02 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.87 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  42.39 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  43.67 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  42.5 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  43.56 
 
 		 287 aa  131  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  40.35 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  40.35 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  44.16 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.59 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.26 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  40.88 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  39.13 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  37.77 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 207 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 275 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  36.75 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  34.72 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  40.26 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.73 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  44.7 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  40.4 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.9 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  35.19 
 
 		 286 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.83 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  42.11 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.89 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.57 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.85 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.13 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>