More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3800 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  98.17 
 
 		 219 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  86.85 
 
 		 213 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  86.54 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  86.54 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  86.54 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  86.06 
 
 		 210 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  82.54 
 
 		 210 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  56.6 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  51.4 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  51.43 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  54.9 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  49.51 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  41.86 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  42.06 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  43.35 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  41.99 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  41.03 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  35 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  40.67 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  35.26 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.24 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  38.26 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40.71 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.85 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 191 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  33.77 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  35.1 
 
 		 297 aa  94.4  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  42.73 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.75 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  29.65 
 
 		 287 aa  89  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  32.05 
 
 		 286 aa  88.6  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  32.17 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.86 
 
 		 291 aa  88.2  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 197 aa  88.6  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  38.76 
 
 		 706 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  35.93 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  33.58 
 
 		 310 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  33.96 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  27.63 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>