More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4631 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 		 200 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 		 196 aa  277  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  74.36 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  69.06 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  50.78 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  56.13 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  56.25 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  53.55 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  53.5 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  54.14 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  52.87 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  44.1 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  46.88 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  47.85 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  51.92 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  46.47 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  46.47 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  43.01 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  46.29 
 
 		 215 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  45.4 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  45.57 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  43.89 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.9 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  47.71 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  43.68 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  40.51 
 
 		 199 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  40.93 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  46.1 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  48.57 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  47.45 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.41 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.84 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  40.22 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  45.99 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  40.45 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  41.98 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  35.14 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  45.26 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 297 aa  124  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  45.38 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  46.85 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  44.53 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  45.19 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  46.92 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  43.97 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  39.13 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  34.76 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  34.22 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  42.65 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  42.65 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  46.48 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  41.06 
 
 		 221 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  47.37 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  42 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  44 
 
 		 229 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  42.31 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  41.29 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  41.96 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  46.27 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>