More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2835 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  92 
 
 		 200 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  73.47 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  69.04 
 
 		 199 aa  300  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  57.87 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  57.87 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  53.61 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  58.43 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  47.59 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  42.49 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  45.24 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  47.8 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.84 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  44.64 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  40.69 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  39.32 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  41.46 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  49.65 
 
 		 196 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  48.95 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 215 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  48.95 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39.9 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  45.07 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  44.1 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  42.33 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  38.42 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.03 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.05 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.37 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  39.41 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.79 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.05 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.79 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  37.87 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.16 
 
 		 197 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.68 
 
 		 297 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  30.3 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.86 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.19 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.05 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
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NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
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