More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2847 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  99.48 
 
 		 205 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  99.48 
 
 		 205 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  97.91 
 
 		 205 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  96.34 
 
 		 205 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  96.86 
 
 		 205 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  94.89 
 
 		 205 aa  347  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  82.72 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  82.72 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  82.72 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  82.72 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  82.72 
 
 		 205 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  80.73 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  84.62 
 
 		 181 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  84.62 
 
 		 181 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  84.07 
 
 		 181 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  78.65 
 
 		 205 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  77.66 
 
 		 205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  72.09 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  72.94 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  65.24 
 
 		 196 aa  259  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  64.06 
 
 		 194 aa  254  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  68.93 
 
 		 200 aa  253  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  67.05 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  67.05 
 
 		 203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  58.06 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  54.3 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  50.53 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  54.95 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  53.4 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  53.33 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  52.75 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  51.61 
 
 		 204 aa  184  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  50.83 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  50.83 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  52.33 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  54.29 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
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NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  47.28 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  52.05 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  50.85 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  47.49 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  48.72 
 
 		 264 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  51.08 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
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NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.36 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  44.38 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  38.76 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  44.17 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  43.62 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  39.79 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  40.22 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  44.51 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  44.1 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  40.22 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  44.94 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  43.23 
 
 		 218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  45.27 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  49.24 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.08 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  41.94 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  45.59 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  45.52 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  45.52 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  37.77 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  46.76 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  49.24 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 217 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  45.77 
 
 		 229 aa  121  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
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