More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0287 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  87.25 
 
 		 205 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  86.76 
 
 		 205 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  75.12 
 
 		 205 aa  324  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  76.7 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  76.7 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  76.7 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  76.7 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  76.7 
 
 		 205 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  75.12 
 
 		 205 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  75.12 
 
 		 205 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  74.63 
 
 		 205 aa  321  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  74.63 
 
 		 205 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  77.37 
 
 		 191 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  74.15 
 
 		 205 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  80.66 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  80.11 
 
 		 181 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  80.11 
 
 		 181 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  70.45 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  68.93 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  62.44 
 
 		 203 aa  254  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  66.86 
 
 		 203 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  66.67 
 
 		 200 aa  248  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  58 
 
 		 196 aa  241  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  60.64 
 
 		 194 aa  241  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  60.56 
 
 		 209 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  53.55 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  51.37 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  51.3 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  54.1 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  51.22 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  52.81 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  53.11 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  47.67 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  46.91 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  52.49 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  47.85 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  48.73 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  50.56 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  48.02 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  47.65 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  45.98 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  47.65 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  46.05 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  41.15 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  41.5 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  43.56 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  41.11 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.56 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  43.56 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  42.33 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.13 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 219 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  43.96 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  36.87 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  42.59 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  42.62 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  48.2 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  48.92 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  42.5 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  48.28 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.68 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  39.34 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  41.81 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  37.29 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  45.32 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  47.1 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  47.1 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  41.38 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.8 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  44.94 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  39.46 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  45.65 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  37.43 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.05 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  43.62 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  42.96 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  46.97 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>