More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1255 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  77.67 
 
 		 210 aa  343  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  66 
 
 		 203 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  68.48 
 
 		 187 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  65.02 
 
 		 207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  63.5 
 
 		 201 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  59.39 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 		 209 aa  256  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  57.21 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  60.5 
 
 		 198 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  59.36 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  59.04 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  59.66 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  55.68 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  55.68 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  55.68 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  55.68 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  55.68 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  56.67 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  56.67 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  56.67 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  56.57 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  55.81 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  56.65 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  55.43 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  53.55 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  52 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  54.8 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  54.3 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  54.3 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  54.3 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  53.76 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  51.49 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  49.03 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  53.76 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  53.23 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  55.75 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  53.89 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  48 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  50.24 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  47.13 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  46.63 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  48.57 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  47.34 
 
 		 264 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  40.72 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  40.12 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  43.03 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  44.83 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  45.14 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  44.14 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  42.94 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.7 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.07 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.74 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  44.7 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  38.65 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  36.51 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
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NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  43.85 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  34.83 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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