More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1375 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  88.84 
 
 		 215 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  89.47 
 
 		 215 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  43.01 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.36 
 
 		 199 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  38.54 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  42.71 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  42.71 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  42.19 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  43.52 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.84 
 
 		 197 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.21 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  41.1 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  41.1 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.68 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  37.31 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.65 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  41.42 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.33 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 196 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  43.02 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  38.79 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  34.48 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  44.53 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  33.54 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.99 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  42.96 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  44.35 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.39 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  34.55 
 
 		 287 aa  111  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.46 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  36.93 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.13 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  30.93 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.53 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.53 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.53 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.53 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.93 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.93 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  37.25 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  43.36 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  34.71 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.76 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.17 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  39.69 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.71 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  38.93 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  39.06 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  31.91 
 
 		 171 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>