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for query gene Dshi_3622 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  45.03 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  43.23 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  43.23 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.51 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40.35 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  43.95 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  43.59 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  42.95 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.48 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  41.4 
 
 		 231 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.99 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  48.82 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.84 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  44.07 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  44.07 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
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NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  46.27 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  39.47 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  44.78 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  45.52 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 221 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  32.98 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  38.56 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  41.35 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  41.48 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  42.22 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
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NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  36.98 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  37.91 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  41.1 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  36.67 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
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NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  34.36 
 
 		 291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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