More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0248 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 203 aa  416  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  98.52 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  89.45 
 
 		 200 aa  342  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  78.03 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  73.99 
 
 		 204 aa  284  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  68.09 
 
 		 196 aa  277  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  66.49 
 
 		 194 aa  275  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  62.56 
 
 		 205 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  62.56 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  62.56 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  62.56 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  62.56 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  63.78 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  63.78 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  64.44 
 
 		 181 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  65 
 
 		 181 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  65 
 
 		 181 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  64.8 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  64.74 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  64.17 
 
 		 205 aa  257  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  62.76 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  64.29 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  66.67 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  61.27 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  59.8 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  54.74 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  52.36 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  55.74 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  53.85 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  55 
 
 		 207 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  53.4 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  54.14 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  52.51 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  52.51 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  49.26 
 
 		 206 aa  200  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  54.07 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  54.02 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  49.24 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  53.98 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  52.54 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  49.73 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
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NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  48.52 
 
 		 264 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  46.35 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  46.25 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  41.03 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  40.51 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  38.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.8 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  42.13 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  46.25 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  41.71 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  45.29 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.29 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  45.29 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  44.12 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  43.31 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  45.62 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36.41 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  46.26 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  49.64 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  38.51 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  39.08 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  40.57 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  39.11 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  45.22 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.61 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  46.76 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  44.29 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  44.9 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.25 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
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NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  43.66 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
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NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  42.14 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  42.14 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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